Los documentos del Sistema de la Calidad forman un conjunto de documentos ordenados y relacionados entre s de modo que se citan y complementan unos a otros, proporcionando un entorno centralizado y controlado al sistema de información. El número y tipo de documentos necesario vara de un laboratorio a otro y depende de la norma según la cual el laboratorio se vaya a certificar o acreditar. A continuación se muestra un esquema de los documentos del Sistema de la Calidad para un laboratorio de Análisis Clnicos según el decreto 108/2000 de Gobierno Valenciano.

El manual de calidad está estructurado en procedimientos generales (PG) y procedimientos especficos (PE).

Se ofrecen también ejemplos de cada tipo de estos documentos.